Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TceancQ3US16 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TceancQ3US16 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms