Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsf3Q3URE1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsf3Q3URE1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsf3Q3URE1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsf3Q3URE1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsf3Q3URE1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acsf3Q3URE1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms