Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
E130208F15RikQ3UPV3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms