Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms