Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd27Q3UMR0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd27Q3UMR0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms