Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cobll1Q3UMF0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms