Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog7Q3UM29 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms