Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CrxosQ3UL53 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms