Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Greb1Q3UHK3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Greb1Q3UHK3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms