Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitpnm3Q3UHE1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms