Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx27Q3UHD6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx27Q3UHD6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms