Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc177Q3UHB8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms