Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms