Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Puf60Q3UEB3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Puf60Q3UEB3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms