Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pid1Q3UBG2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms