Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3U6N9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3U6N9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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