Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U595 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U595 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U595 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U595 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U595 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U595 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U595 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U595 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U595 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q3U595 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U595 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U595 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U595 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U595 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U595 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U595 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U595 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U595 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U595 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q3U595 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q3U595 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q3U595 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q3U595 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q3U595 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q3U595 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms