Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp4Q3U4B1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms