Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Kdm4dQ3U2K5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Kdm4dQ3U2K5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Kdm4dQ3U2K5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdm4dQ3U2K5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms