Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms