Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hace1Q3U0D9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 705.6 ms