Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl4Q3TZA2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl4Q3TZA2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms