Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc136Q3TVA9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc136Q3TVA9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ccdc136Q3TVA9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms