Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQZ4

Gm2016, Predicted gene 2016, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2016Q3TQZ4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2016Q3TQZ4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2016Q3TQZ4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2016Q3TQZ4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm2016Q3TQZ4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm2016Q3TQZ4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm2016Q3TQZ4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm2016Q3TQZ4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms