Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Calr4Q3TQS0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms