Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cwc27Q3TKY6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc27Q3TKY6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms