Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xlr4cQ3TKR2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xlr4cQ3TKR2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xlr4cQ3TKR2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xlr4cQ3TKR2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xlr4cQ3TKR2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xlr4cQ3TKR2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xlr4cQ3TKR2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xlr4cQ3TKR2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xlr4cQ3TKR2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms