Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hddc2Q3SXD3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc2Q3SXD3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms