Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXA2

Vmn1r11, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r11Q3SXA2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r11Q3SXA2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r11Q3SXA2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms