Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zbtb38Q3LR78 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zbtb38Q3LR78 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms