Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-M3Q31093 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms