Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbp8Q2V6D6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbp8Q2V6D6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms