Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms