Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrp1aQ2LKU9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms