Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms