Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Samd11Q1RNF8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Samd11Q1RNF8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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