Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rpusd2Q149F1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rpusd2Q149F1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Rpusd2Q149F1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd2Q149F1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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