Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc162pQ0VG85 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms