Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atp2b3Q0VF55 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms