Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam83bQ0VBM2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms