Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms