Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vps8Q0P5W1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps8Q0P5W1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms