Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SctQ08535 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SctQ08535 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SctQ08535 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SctQ08535 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SctQ08535 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SctQ08535 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SctQ08535 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SctQ08535 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SctQ08535 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SctQ08535 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SctQ08535 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms