Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff1Q08423 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tff1Q08423 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tff1Q08423 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tff1Q08423 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tff1Q08423 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tff1Q08423 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tff1Q08423 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tff1Q08423 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tff1Q08423 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tff1Q08423 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tff1Q08423 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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