Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CbfbQ08024 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CbfbQ08024 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms