Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MestQ07646 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MestQ07646 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MestQ07646 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MestQ07646 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MestQ07646 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MestQ07646 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MestQ07646 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MestQ07646 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MestQ07646 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MestQ07646 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MestQ07646 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MestQ07646 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MestQ07646 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MestQ07646 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MestQ07646 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MestQ07646 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MestQ07646 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MestQ07646 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms