Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col17a1Q07563 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col17a1Q07563 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Col17a1Q07563 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col17a1Q07563 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Col17a1Q07563 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms