Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nfe2Q07279 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nfe2Q07279 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms