Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox4Q06831 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms