Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2Q06649 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms